S:t Bishoi grundade två kloster i Wadi Natrun: Dels det som bär hans namn, samt det angränsande Deir el Sourian.
Deir Anba Bishoi är uppbyggd kring en kyrka som innehåller relikerna efter helgonets kropp, som sägs vara perfekt bevarad i ett förslutet, tub-liknande relikskrin. Den 17 juli varje år förs relikskrinet i procession runt kyrkan. Enligt munkarna, de som känner de som bär skrinet tydligt vikten av en hela helgonets kropp. -I kyrkan finns också en cell där St Bishoi band sitt hår till taket för att förhindra sig att falla i sömn under bönen. Innanför klostermurarna finns även en härlig klosterträdgård med ett imponerande grönsaksland, en enorm ny katedral samt ett intressant skyddstorn som du endast når via en vindbrygga. Tornet innehåller en egen brunn, kök, två kyrkor samt förrådsrum som kan magasinera en årsranson med mat för klostret. På taket finns luckor som leder till små munkceller som även fungerade som provisoriska gravar för dem som dog under de frekventa belägringarna av klostret under 800-talet. Taket är även en utmärkt palts för att se solnedgången i det omgivande öknenlandskapet.